Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrxO54751 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrxO54751 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxO54751 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxO54751 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms