Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN3O15551 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN3O15551 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms