Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5849J3QPE5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms