Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LAMB4A4D0S4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAMB4A4D0S4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms