Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNSTRNQ9Y448 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KNSTRNQ9Y448 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KNSTRNQ9Y448 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms