Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LTBP3Q9NS15 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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