Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Wdr61Q9ERF3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr61Q9ERF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms