Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CrotQ9DC50 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms