Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Actrt1Q9D9J3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms