Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GINS3Q9BRX5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GINS3Q9BRX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms