Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDF4Q9BRK5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms