Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim12aQ99PQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim12aQ99PQ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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