Protein–RNA interactions for Protein: Q99N48

Sytl3, Synaptotagmin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sytl3Q99N48 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sytl3Q99N48 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sytl3Q99N48 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sytl3Q99N48 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms