Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG3Q96JB2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COG3Q96JB2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms