Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UTP4Q969X6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms