Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx4Q91YJ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx4Q91YJ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms