Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPC1Q8WXF1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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