Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HJURPQ8NCD3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms