Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms