Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF1Q7Z6J0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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SH3RF1Q7Z6J0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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SH3RF1Q7Z6J0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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SH3RF1Q7Z6J0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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SH3RF1Q7Z6J0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3RF1Q7Z6J0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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