Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv4Q5R1A3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms