Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GABRA6Q16445 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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