Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH18Q13634 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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