Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YIR014WYIR014W 729 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 RPL17BYJL177W 555 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YJR111CYJR111C 852 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 BUD21YOR078W 645 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 IDH2YOR136W 1110 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 AFR1YDR085C 1863 nt3.51□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 SIN3YOL004W 4611 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 NEL1YHR035W 1893 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 PIN4YBL051C 2007 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 ASI3YNL008C 2031 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 AGE2YIL044C 897 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YJL119CYJL119C 324 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 ATP18YML081C-A 180 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 NDC80YIL144W 2076 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 SYO1YDL063C 1863 nt3.5□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 GPI1YGR216C 1830 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 LST4YKL176C 2487 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YDL187CYDL187C 330 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 TGL2YDR058C 981 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YGL074CYGL074C 327 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YGR045CYGR045C 363 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YKE2YLR200W 345 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 GRE2YOL151W 1029 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YBR137WYBR137W 540 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 SUC2YIL162W 1599 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 GPI10YGL142C 1851 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 VPS9YML097C 1356 nt3.49□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 NUP159YIL115C 4383 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 HDA2YDR295C 2025 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 OPI6YDL096C 327 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 PAU10YDR542W 363 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 NTF2YER009W 378 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 MIG3YER028C 1185 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 TDA2YER071C 381 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 RPS8BYER102W 603 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 PAU11YGL261C 363 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YGR228WYGR228W 345 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 PAU13YHL046C 363 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 PAU4YLR461W 363 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 RPL19BYBL027W 570 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 RPS8AYBL072C 603 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 MRPS9YBR146W 837 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 SEC66YBR171W 621 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 KRI1YNL308C 1776 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 OSH3YHR073W 2991 nt3.48□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 AKR1YDR264C 2295 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 ERG11YHR007C 1593 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 FRE4YNR060W 2160 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 MRPL11YDL202W 750 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 TIM10YHR005C-A 282 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YLR257WYLR257W 966 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YLR400WYLR400W 474 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 YBL028CYBL028C 321 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 SWS2YNL081C 432 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 INO4YOL108C 456 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 ATX2YOR079C 942 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 RSA1YPL193W 1146 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 RPC40YPR110C 1008 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 MDM36YPR083W 1740 nt3.47□□□□□ -1.85
LCB4Q12246 PEP7YDR323C 1548 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YDR199WYDR199W 366 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 MET32YDR253C 576 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YEL075CYEL075C 369 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 FMP10YER182W 735 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 FAR7YFR008W 666 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YGR018CYGR018C 330 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 SAS2YMR127C 1017 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 MRPL44YMR225C 297 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 AAR2YBL074C 1068 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YNL324WYNL324W 396 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 TIR2YOR010C 756 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 APC5YOR249C 2058 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 TAF6YGL112C 1551 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 XRS2YDR369C 2565 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 EXO5YBR163W 1758 nt3.46□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 STU1YBL034C 4542 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 APL4YPR029C 2499 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 MSR1YHR091C 1932 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 ASG7YJL170C 630 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 VAM10YOR068C 345 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YPL107WYPL107W 747 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 AFT2YPL202C 1251 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 IRC3YDR332W 2070 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 NRP1YDL167C 2160 nt3.45□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 RGL1YPL066W 1440 nt3.44□□□□□ -1.86
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