Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLFN5Q08AF3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms