Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC4Q03721 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms