Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFITM3Q01628 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms