Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 MAM1YER106W 909 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 STE2YFL026W 1296 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RCN1YKL159C 636 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 TDA8YAL064C-A 381 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YAR069CYAR069C 294 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YNL050CYNL050C 813 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SME1YOR159C 285 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SRL4YPL033C 846 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 TMA108YIL137C 2841 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 CPA2YJR109C 3357 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YDR089WYDR089W 2610 nt3.34□□□□□ -1.88
HEF3P53978 STP1YDR463W 1560 nt3.34□□□□□ -1.88
HEF3P53978 RTT10YPL183C 3042 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 NAB3YPL190C 2409 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YHL044WYHL044W 708 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 PBA1YLR199C 831 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 TPT1YOL102C 693 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 PEX11YOL147C 711 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YOR203WYOR203W 354 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 DGA1YOR245C 1257 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ARL3YPL051W 597 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 VPS38YLR360W 1320 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 PIG2YIL045W 1617 nt3.33□□□□□ -1.88
HEF3P53978 SSE2YBR169C 2082 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 CCM1YGR150C 2595 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 RPL14BYHL001W 417 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 PCD1YLR151C 1023 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YLR217WYLR217W 324 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ERG29YMR134W 714 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 VAM10YOR068C 345 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YBR090CYBR090C 369 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 URK1YNR012W 1506 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 POL2YNL262W 6669 nt3.32□□□□□ -1.88
HEF3P53978 NGG1YDR176W 2109 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 SPO14YKR031C 5052 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YLR108CYLR108C 1458 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ERP3YDL018C 678 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 UBC5YDR059C 447 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YHR054CYHR054C 1065 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YIL174WYIL174W 228 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 RPS28BYLR264W 204 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 RLP7YNL002C 969 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 KAR4YCL055W 1008 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 PSP1YDR505C 2526 nt3.31□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ARG2YJL071W 1725 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YJL132WYJL132W 2253 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 AI3Q0060 1248 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YDR042CYDR042C 603 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 SEC4YFL005W 648 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YGR115CYGR115C 780 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 GPI14YJR013W 1212 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 PDR1YGL013C 3207 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 SEC26YDR238C 2922 nt3.3□□□□□ -1.88
HEF3P53978 CST9YLR394W 1449 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YJL049WYJL049W 1353 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ESA1YOR244W 1338 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 GIN4YDR507C 3429 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 BCK1YJL095W 4437 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 MRPL9YGR220C 810 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 PEX18YHR160C 852 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YIR040CYIR040C 333 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 NNT1YLR285W 786 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YBL028CYBL028C 321 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 RPL23AYBL087C 414 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 RRG7YOR305W 729 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 POL30YBR088C 777 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ARL1YBR164C 552 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 STP2YHR006W 1626 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 EMP70YLR083C 2004 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ERT1YBR239C 1590 nt3.29□□□□□ -1.88
HEF3P53978 BUD4YJR092W 4344 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 BUB1YGR188C 3066 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ESL1YIL151C 3357 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ESC2YDR363W 1371 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 TAO3YIL129C 7131 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YPD1YDL235C 504 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YDR203WYDR203W 318 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 MST27YGL051W 705 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 LIF1YGL090W 1266 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 RPL13BYMR142C 600 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 NAB6YML117W 3405 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 CDC20YGL116W 1833 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 ATP25YMR098C 1839 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 NUR1YDL089W 1455 nt3.28□□□□□ -1.88
HEF3P53978 DOA4YDR069C 2781 nt3.28□□□□□ -1.89
HEF3P53978 PFF1YBR074W 2931 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 VPS9YML097C 1356 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 CLB3YDL155W 1284 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 YDL242WYDL242W 354 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 MFA1YDR461W 111 nt3.27□□□□□ -1.89
HEF3P53978 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.27□□□□□ -1.89
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