Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rpl28P41105 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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