Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG3P32926 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG3P32926 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG3P32926 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG3P32926 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG3P32926 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG3P32926 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG3P32926 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG3P32926 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSG3P32926 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSG3P32926 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms