Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB2P26583 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMGB2P26583 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB2P26583 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms