Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KB1P23443 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms