Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VEGFAP15692 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VEGFAP15692 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms