Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NME1P15531 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NME1P15531 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NME1P15531 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NME1P15531 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NME1P15531 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NME1P15531 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME1P15531 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms