Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GP1BBP13224 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms