Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEFHP12036 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEFHP12036 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEFHP12036 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEFHP12036 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEFHP12036 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEFHP12036 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEFHP12036 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEFHP12036 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEFHP12036 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms