Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L7P0C7H9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms