Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3JO75822 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3JO75822 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms