Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDELR3O43731 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR3O43731 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDELR3O43731 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDELR3O43731 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KDELR3O43731 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KDELR3O43731 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms