Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bnc1O35914 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnc1O35914 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnc1O35914 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnc1O35914 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bnc1O35914 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms