Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR1CO15160 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms