Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC117090L7N257 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms