Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMKR1H3BMG3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMKR1H3BMG3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms