Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r76F8VQ63 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r76F8VQ63 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms