Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28305F6U473 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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