Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms