Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc166S4R181 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc166S4R181 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc166S4R181 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc166S4R181 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc166S4R181 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc166S4R181 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc166S4R181 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc166S4R181 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc166S4R181 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms