Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gria3Q9Z2W9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gria3Q9Z2W9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gria3Q9Z2W9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gria3Q9Z2W9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gria3Q9Z2W9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria3Q9Z2W9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gria3Q9Z2W9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria3Q9Z2W9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gria3Q9Z2W9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gria3Q9Z2W9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms