Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RfxankQ9Z205 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RfxankQ9Z205 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RfxankQ9Z205 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfxankQ9Z205 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfxankQ9Z205 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfxankQ9Z205 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RfxankQ9Z205 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RfxankQ9Z205 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfxankQ9Z205 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RfxankQ9Z205 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RfxankQ9Z205 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RfxankQ9Z205 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RfxankQ9Z205 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RfxankQ9Z205 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RfxankQ9Z205 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RfxankQ9Z205 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms