Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddx39bQ9Z1N5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ddx39bQ9Z1N5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ddx39bQ9Z1N5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ddx39bQ9Z1N5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ddx39bQ9Z1N5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx39bQ9Z1N5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx39bQ9Z1N5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms